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カピバラ博士の分子動力学計算マニュアル


プロの計算を無料のソフトで!

まるで見てきたかのように分子の運動をシミュレーションできる、そんな分子動力学計算の仕方をヒカリちゃんと一緒にカピバラ博士に教えてもらおう!

Linuxベースの計算環境の構築の仕方から、入力ファイルの作り方、計算結果の可視化解析まで、理屈はひとまずとにかく一通りやってみるマニュアル本。

-内容-
第1章. 計算環境を整えよう
I. Windows上の計算環境を整えよう
II. Ubuntu上の計算環境を整えよう

第2章. 包接現象をシミュレーションしよう
I. 量子化学計算を行おう
II. 分子動力学計算を行おう
III. 計算結果を可視化・解析しよう

第3章. 水素結合を定量評価しよう

第4章. 有機色素の計算に挑戦しよう


こんな計算ができます



☆ 水溶液中でベンゼンがβ-シクロデキストリンに包摂される様子


サンプル画像









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